Die Fireflies sind eine radikale Untergrundorganisation, die für die Freiheit der Menschen in der postapokalyptischen Welt kämpft.

Nach dem Ausbruch der Cordyceps-Seuche durch eine parasitäre Pilzart verfiel die Gesellschaft in der Welt von "The Last of Us" weltweit sehr schnell. Milliarden Menschen starben. Nach 20 Jahren leben die wenigen Überlebenden auf dem Gebiet der ehemaligen USA in von der diktatorischen Militärdiktatur namens FEDRA verwalteten Quarantänezonen.

Dieser faschistischen Oppression von FEDRA stellt sich die Untergrundgruppierung entgegen, die sich selbst "Fireflies", Glühwürmchen, nennt. Dabei gehen sie nicht weniger zimperlich vor als ihre Gegner, sind im ganzen Land vernetzt und gut organisiert und führen einen Guerilla-Krieg, um die staatliche Ordnung, Frieden und die Bürgerrechte wiederherzustellen.

So sind die Fireflies aufgestellt
Gegründet wurden die Fireflies einige Jahre nach dem Ausbruch, nach dem Einsatz des Kriegsrechts durch FEDRA und ihrer damit verbundenen Übernahme der staatlichen Autorität.

In Boston werden die Fireflies von XXX angeführt. Er organisiert Überfälle auf FEDRA-Posten und Diebstähle von Waffen und Ausrüstung. Ihr Ziel ist es, die Militärdiktatur aus Boston zu vertreiben und den Menschen die Freiheit wiederzugeben. Mit allen Mitteln, die dafür notwendig sind.

Die "Federal Disaster Response Agency", kurz FEDRA, ersetzte nach dem Ausbruch des Cordyceps-Pilzes und dem folgenden Zusammenbruch der Gesellschaft die US-Regierung als autoritäre Kraft im Land. Was zuerst dem Schutz der überlebenden Bevölkerung vor Plünderern und Infizierten und der Einrichtung von Quarantäne-Zonen diente, entwickelte sich schnell zu einer regelrechten Militärdiktatur, bei der FEDRA im ganzen Land aktiv ist und Menschen unterdrückt.

Innerhalb der 20 Jahre, die zwischen dem Ausbruch und der Geschichte vergingen, entwickelte FEDRA, nun wie ein Militärstaat funktionierend, ein eigenes Kontaminierungs-Protokoll. Danach werden Infizierte in mehrere Gruppen unterteilt. Zudem sorgen sie dafür, dass keine Infizierten oder Kranken in die Stadt gelangen.